Cezarina surgiu em 1960, com a construção da BR-060.
Nessa época, o fazendeiro João Argemiro Cezar resolveu lotear suas terras, onde hoje está o centro da cidade. Contratou o agrimensor Agil José da Rocha para fazer o serviço de demarcação, fizeram um acordo que seu pagamento seria uma área de terra. Agil José construiu um posto de gasolina à margem da rodovia, que se tornou a primeira edificação do povoado.
Anos depois, outro fazendeiro, Orlando Ferreira de Oliveira, também loteou parte de sua fazenda. Com isso, o povoado foi se formando, atraindo famílias de vários lugares.
O lugar passou a se chamar Cezarina devido ao seu fundador.

Formação Administrativa
Distrito criado com a denominação de Cezarina (ex-povoado), pela Lei Estadual n.º 8.105, de 14-05-1976, subordinado município de Palmeira de Goiás.
Em divisão territorial datada de 1-I-1979, o distrito figura no município de Palmeira de Goiás.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 1-VII-1983.
Elevado à categoria de município com a denominação de Cezarina, pela Lei Estadual n.º 10.413, de 01-01-1988, desmembrado de Palmeira de Goiás e Indiara. Sede no antigo distrito de Cezarina. Constituído do distrito sede. Instalado em 01-01-1989.
Em divisão territorial datada de 2001, o município é constituído do distrito sede.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2018.

Fonte: IBGE